ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه‌های عامل بیماری نوار قهوه‌ای برنج با استفاده از rep-PCR *

Authors

  • حشمت‌اله رحیمیان نویسنده
Abstract:

بیماری نوار قهوه‌ای برنج (brown stripe of rice) از خزانه‌های برنج (Oryza  sativa L.)استان مازندران گزارش و عامل آن(Aaa)Acidovorax avenae subsp. avenae  شناسایی شده‌است (Rahimian. 1986, Iran Agric. Res. 5: 63-71). بررسی حاضر به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه‌های به دست آمده از خزانه های برنج استان مازندران انجام گرفت. پس از کشت نمونه‌های دارای علائم نوار قهوه‌ای و بر اساس آزمون‌های بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی، جدایه‌ها به عنوان Aaa  شناسایی و برای بررسی ژنوتیپی به کار برده شدند. نتایج آزمون‌های اکسیداز، کاتالاز، هیدرولیز نشاسته، هیدرولیز کازئین و هیدرولیز توئین 80 مثبت بودند. جدایه‌ها از سوربیتول و مانیتول به عنوان منبع کربنی استفاده کرده ولی قادر به استفاده از سوکروز و سالیسین نبودند(Rahimian. 1986, Iran Agric. Res. 5: 63-71). DNA ژنومی جدایه‌ها استخراج و انگشت نگاری DNA با rep-PCR و با استفاده ازآغازگرهای BOX و REP طبق روش های توصیه شده و با اندکی تغییر انجام گردید ( Versalovic  et al. 1991, Nucleic Acids Res. 19: 6823-6831 ). گروه‌بندی جدایه‌ها با مقایسه نقوش قطعات DNA در ژل و نمره‌دهی بر پایه وجود یا عدم وجود قطعات همسان و با استفاده از ضریب تشابه جاکارد صورت گرفت. دندروگرام با روش مقایسه جفت‌ها از طریق میانگین‌های بی‌وزن (UPGMA) و با استفاده از نرم‌افزار NTSYS 2.02 ترسیم گردید. مقایسه نقوش قطعات DNA تکثیر شده درrep-PCR، نشان داد که در سطح تشابه 20، 50 و 80 درصد جدایه‌ها با آغازگر BOX به ترتیب به 7، 16 و 23 گروه و با آغازگر REP به ترتیب به 5، 13 و 19 گروه دسته‌بندی شدند. خوشه‌بندی به دست آمده با نقوش حاصل از REP-PCR مطابقت بالایی با خوشه‌بندی انجام گرفته با BOX-PCRداشت. پیش از این گزارشی در زمینه وجود سطح بالایی از تنوع ژنتیکی در جمعیت‌های این عامل باکتریایی در دست نبوده است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های Sclerotinia sclerotiorum با استفاده از نشانگر *rep-PCR

بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه کلزا ناشی از Sclerotinia sclerotiorum یکی از مهم‌ترین بیماری‌های قارچی کلزا در ایران می‌باشد. با توجه به اهمیت این بیماری و عدم وجود اطلاعات کامل از ساختار ژنتیکی جمعیت‌های این قارچ گروه‌های سازگاری میسلیومی و تنوع ژنتیکی بین و درون گروه‌های سازگاری میسلیومی (mycelial compatibility grouping, MC...

full text

ارزیابی مقاومت ارقام مختلف مرکبات نسبت به Alternaria alternata عامل بیماری لکه قهوهای مرکبات با استفاده از RAPD-PCR

    نیکو کاکوان1*، حمیدرضا زمانی زاده2، بهار مرید1، شهاب حاج منصور2، حسین طاهری3   1 -گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تاکستان، تاکستان، ایران   2-گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران   3- بخش آفات و بیماریهای گیاهی، موسسه تحقیقات مرکبات، رامسر، ایران     * نویسنده مسئول: [email protected]     تاریخ پذیرش:12...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی زانتوموناس عامل لکه زاویه‌ای توسکا در استان‌های مازندران و گلستان با استفاده از BOX-PCR و*REP-PCR

توسکا یکی از مهم‌ترین گونه‌های درختی جنگل‌های شمال کشور بوده و از نظر اقتصادی به عنوان چهارمین درخت تجاری محسوب می‌شود. یک بیماری لکه برگی ناشی از گونه‌ای زانتوموناس در توسکا ییلاقی (Alnus subcordata subsp. Subcordata) در چند منطقه جنگلی استان مازندران گزارش شده است (Rahimian et al. 1383. 16th Iran. Plant Pr...

full text

تنوع ژنتیکی جدایه های Acidovorax oryzae عامل نوار قهوه ای برنج در استان مازندران

بیماری نوار قهوه‌ای برنج (brown stripe of rice ) یکی از بیماری‌های شایع در خزانه‌های برنج (Oryza  sativa)  می‌باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی عامل نوار قهوه ای برنج، نمونه برداری، در فصول زراعی 1391-1390 از خزانه های مازندران انجام شد. عامل بیماری بر اساس آزمون‌های بیوشیمیائی، فیزیولوژیکی و بیماری‌زائی Acidovorax  avenae subsp. avenae ( Acidovorax oryzae...

full text

مطالعۀ تنوع ژنتیکی جدایه‌های قارچ Fusarium verticillioides عامل بیماری پوسیدگی ریشۀ برنج با استفاده از نشانگر SSR

بیماری پوسیدگی ریشۀ ناشی از Fusarium verticillioides یکی از مهم‌ترین بیماری‌های برنج در ایلام است. برای تعیین تنوع ژنتیکی بیمارگر در شالیزارهای استان ایلام، تعداد 56 نمونۀ آلوده از مزارع شهرستان‌های مختلف جمع‌آوری شد. پس از کشت، خالص‌سازی و شناسایی جدایه‌ها، آزمون مولکولی با استفاده از پنج جفت آغازگر ریزماهواره انجام گرفت. از آغازگرهای ریزماهواره 26 آلل در جدایه‌ها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل د...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی زانتوموناس عامل لکه زاویه ای توسکا در استان های مازندران و گلستان با استفاده از box-pcr و*rep-pcr

توسکا یکی از مهم ترین گونه های درختی جنگل های شمال کشور بوده و از نظر اقتصادی به عنوان چهارمین درخت تجاری محسوب می شود. یک بیماری لکه برگی ناشی از گونه ای زانتوموناس در توسکا ییلاقی (alnus subcordata subsp. subcordata) در چند منطقه جنگلی استان مازندران گزارش شده است (rahimian et al. 1383. 16th iran. plant protec. cong.,439). براساس یک بررسی ژنومی که در سال های اخیر انجام شده بود باکتری عامل بیم...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 49  issue 2

pages  279- 280

publication date 2013-12-01

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023